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微波萃取技術(shù)的特殊優(yōu)點(diǎn)使其成為樣品萃取的有力工具，并已被應(yīng)用于土壤、食品、肉類、蔬菜、油脂、蛋類、奶制品、沉積物等樣品以萃取多環(huán)芳烴（PAHs）、農(nóng)藥殘留、油脂、芳香油、微量元素及其化合物、有機(jī)金屬化合物、植物中有效成分、有害物質(zhì)、霉菌毒素、礦物中金屬的萃取以及血清中藥物、生物樣品中農(nóng)藥殘留的萃取研究。根據(jù)微波萃取在不同領(lǐng)域中的應(yīng)用分類如下：
1．  微波萃取農(nóng)藥殘留
       一般樣品中的農(nóng)殘含量很低（ppm-ppt），用微波萃取法同等樣品量只需用較少的萃取溶劑（約1/10）即可，實(shí)際上提高了分析方法的靈敏度。但微波萃取不同基體中的農(nóng)藥殘留，需要選用與常規(guī)法不同的萃取溶劑，以使溶劑不僅能較好地吸收微波能，而且可有效地從樣品中把農(nóng)藥殘留成分萃取出來(lái)。研究表明，用異辛烷、正己烷/丙酮、苯/丙酮（2;1）、甲醇/醋酸、甲醇/正己烷、異辛烷/乙腈等作溶劑，在土壤或沉積物有一定濕度的條件下，微波萃取方法僅用3分鐘就可獲得與Soxhlet提取法用6小時(shí)才能取得的相同的有機(jī)氯農(nóng)藥殘留回收率。有實(shí)驗(yàn)萃取土壤中12種農(nóng)殘（艾氏劑、α-六六六，β-六六六、4,4’-DDT，狄氏劑，硫丹I、硫丹II、異狄氏劑、七氯、環(huán)氧七氯、七氯苯、七氯環(huán)戊二烯）的回收率結(jié)果與常規(guī)EPA方法進(jìn)行對(duì)照，結(jié)果表明微波萃取10分鐘的回收率和精密度均好于EPA規(guī)定的索氏法。已應(yīng)用過(guò)微波法萃取農(nóng)藥殘留的其他樣品有肉類、雞蛋和奶制品，土壤、砂子、吸塵器所得灰塵、水和沉積物，豬油，蔬菜（甜菜、黃瓜、萵苣、辣椒和西紅柿），大蒜和洋蔥。
2．有機(jī)污染物得微波萃取
     土壤、河泥、海洋沉積物、環(huán)境灰塵以及水中的有機(jī)污染物一般指高聚物、多環(huán)芳烴、氯化物、苯、除草劑、潤(rùn)滑油和酚類等。微波萃取不同基體中有機(jī)污染物的優(yōu)點(diǎn)是只需用常規(guī)萃取方法十分之一的溶劑，約5-20分鐘萃取時(shí)間即可。應(yīng)用到土壤樣品中多環(huán)芳烴，酚類化合物，河泥、海洋沉積物、環(huán)境灰塵中有機(jī)污染物，水中的多氯聯(lián)苯和其他有機(jī)污染物。土壤中的烷烴、多環(huán)芳烴和除草劑，水，沉積物和生物組織中的多環(huán)芳烴都已用過(guò)這種方法。
3．金屬及其化合物的微波萃取
     土壤、河泥、沉積物、海洋生物河一些植物樣品中重金屬元素及有毒元素（如錫、汞、鉛、鋅、砷、銻等）都是需要經(jīng)常檢測(cè)的項(xiàng)目。微波萃取方法富集和分離出這些元素或其化合物，不僅試劑消耗少，制樣快，而且檢測(cè)靈敏度高。影響微波萃取不同基體中金屬及其化合物的主要因素為萃取溫度、溶劑中酸的量、萃取時(shí)間和溶劑（甲苯）量。微波幫助萃取土壤、海洋沉積物、礦物和礦渣中的金屬元素或其化合物，然后用發(fā)射光譜或質(zhì)譜儀器等進(jìn)行測(cè)定，結(jié)果令人滿意。有研究用4種不同的溶劑，異辛烷、甲醇、去離子水和人造海水，在不同的微波功率下，考察了丁基和苯基錫衍生物的穩(wěn)定性和萃取回收率，如沉積物中的BuSnCl3(MBT),Bu2SnCl2(DBT),Bu3SnCl(TBT),PhSnCl3(MPT),Ph2SnCl2(DPT),Ph3SnCl(TPT)和Ph2SnCl(TP2T)。其研究表明，微波幫助萃取復(fù)雜基體中的有機(jī)金屬化合物，不僅方法可行，費(fèi)用低，而且整個(gè)分析測(cè)試所需時(shí)間可顯著縮短到原來(lái)的約二十至二百分之一。不同基體中元素的微波萃取研究，在海洋生物中甲基汞和砷，生物和植物樣品中銅、鎂、鋅和鉛，河泥中有機(jī)砷、有機(jī)錫河重金屬元素（Cu，Cr，Ni，Pb和Zn），土壤中的汞、鉛、鋅和銅，煤中砷和硒。
4．植物中有效成分的萃取
     天然植物中有效成分的萃取是化學(xué)研究的重要內(nèi)容，這方面微波萃取法也顯示了獨(dú)特的優(yōu)點(diǎn)，已見(jiàn)于文獻(xiàn)的研究報(bào)告有：迷迭香和薄荷中含有迷迭香或薄荷油混合物的提取，蔬菜類植物中吡咯雙烷基生物堿，不同植物中的嘧啶糖甙、棉子酚和生物堿的提取，糧食和牛奶中維生素B的提取，植物中的香精香料，中藥中的重樓皂甙的提取。這些研究表明微波法明顯的優(yōu)點(diǎn)是顯著降低了萃取時(shí)間和減少了溶劑的消耗。經(jīng)微波處理后的油菜籽、橄欖籽和葡萄籽可以提高出油率，這種用微波加快和提高植物油產(chǎn)率的成套裝置已由加拿大某公司生產(chǎn)和銷售。有研究就微波輻射與γ射線對(duì)提取香精香料中不飽和組分影響的研究表明，在2450MHz的微波中輻射20分鐘，九種香精香料中的不飽和組分沒(méi)有受到影響，但5或10KGY（一種輻射計(jì)量單位）的γ射線破壞了香精香料中的不飽和組分。
5．微波萃取法在臨床上的應(yīng)用
     在臨床上，有人用微波選擇性萃取人血或血清中的藥物（鎮(zhèn)靜劑），如Lidocaine,Methadone,Diazepam,Nordiazepan,Propoxyphene,Morpropoxyphene等。這種萃取法已成功地用到了幾個(gè)案例的偵破。從血紅細(xì)胞表面分離抗體的微波萃取法僅需10分鐘，而常規(guī)法需60-90分鐘。微波萃取法也已用到了從血漿中分離及從血清中分離抗原。
6．微波萃取的其他應(yīng)用
     除了在前述的幾個(gè)主要方面的應(yīng)用外，微波萃取還被用于蘑菇、土壤、自然污染和人為污染的谷物等中的真菌毒素、脂肪酸和霉變物中有害物質(zhì)的萃取分離。食品中芳香油和游離氨基酸，豬肉中硫胺二甲嘧啶、蛋黃和蛋白中氯霉素藥殘、橡膠配方中加速凝固劑、聚烯烴中穩(wěn)定劑和添加劑、富勒烯油煙中C60和C70的提取等也都采用了微波萃取技術(shù)。